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科技工作者之家 2020-05-22
来源:brainnews
科 学 时 讯
1,Nat Methods | 苗智超等发展识别人体细胞类型新算法
来源:BioArt
5月18日,英国威康桑格研究所Sarah Teichman课题组和欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)Alvis Brazma课题组合作在Nature Methods上发表 “Putative cell type discovery from single-cell gene expression data”。文章提出了一种自动计算方法用于单细胞测序数据的细胞聚类,该方法(称为单细胞聚类评估框架(Single Cell Clustering Assessment Framework,SCCAF))可以实现对不同细胞类型的自动聚类,并且可能发现新的细胞类型(或者细胞状态)。
SCCAF基于机器学习和自映射对聚类的迭代,先从一个“过度聚类”的细胞聚类开始,逐步合并被机器学习认为是相同细胞的细胞簇。最终,得到一个能被机器学习很好区分的聚类结果,机器学习学到的每种细胞中的特征基因就是用于识别该细胞类型的特征,机器学习模型也可以作为一种新的定义细胞类型的方式。文章测试了许多已经发表的人工注释的数据集,发现SCCAF算法在绝大多数情况下都可以得到与手人工注释相似的结果。
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Nat Methods | 苗智超等发展识别人体细胞类型新算法
2,学习自然!松果启发的智能微笼,用于递送纳/微米粒子
来源:奇物论
药物递送在医学和健康中起着至关重要的作用,但使用刺激触发载体按需递送大尺寸药物是极具挑战性的。目前的大多数胶囊都是由具有纳米孔径(<10 nm)的聚合物致密外壳组成,因此通常缺乏对纳米/微米粒子药物的渗透性。
美国西弗吉尼亚大学李丙运等人报告了一种松果启发的由纤维素纳米纤维(CNFs)组装而成的具有开放网壳的的智能微笼,用于纳米/微米粒子药物递送。这种方法允许纳米结构、功能化的CNFs大规模地组装成机械坚固的、干草堆状的网壳,具有可调的大通孔和多肽锚定点。
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学习自然!松果启发的智能微笼,用于递送纳/微米粒子
3,于翔团队揭示DHA促进大脑神经发育的机制
来源:BioArtDHA与RXRA调控突触发育的作用机制示意图。DHA在特异性磷脂酶iPLA2的作用下,从质膜上释放成为游离DHA;在细胞核内结合其受体RXRA,促进即早基因表达;进而促进树突棘发育及功能性突触形成,最终促进认知及行为表现。大量的研究表明,DHA的缺失与多种神经发育障碍以及神经精神疾病相关,而DHA的补充被认为能够缓解或治疗发育迟缓和神经精神性疾病,甚至是提升正常人群的认知。5月19日,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心/神经科学研究所于翔研究团队在Cell Reports在线发表了题为Retinoid X Receptor α Regulates DHA-dependent Spinogenesis and Functional Synapse Formation in vivo的研究论文。发现了在体内未酯化DHA(游离DHA)能通过RXRA依赖的信号通路调节树突棘及功能性突触的发育,解析了DHA促进大脑发育及功能的新机制,并为相关疾病的治疗提供了新思路。阅读链接:于翔团队揭示DHA促进大脑神经发育的机制4,基于单分子荧光探针用于神经元线粒体内H2O2和ATP的同时定量检测与实时荧光寿命成像
来源:X-MOL资讯
O2•-诱导刺激下神经元线粒体内H2O2和ATP实时荧光寿命成像。线粒体氧化还原稳态与能量代谢对于生物体而言是至关重要的,因为线粒体是各类活性氧物种(reactive oxygen species,ROS)与直接能量来源ATP产生的最主要场所,ROS控制着氧化还原稳态而ATP则主导着能量代谢。在一些神经退行性疾病如阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)中,细胞均表现出异常的氧化应激和能量代谢受损。H2O2,作为相对来说较为稳定的ROS,是维持线粒体氧化还原过程的主要分子之一,也是线粒体氧化损伤的重要信使。ATP则是调节线粒体能量代谢的重要信使。
近日,华东师范大学的田阳教授课题组成功设计并合成了一种基于双光子荧光寿命探针(TFP),该单个探针可同时用于H2O2与ATP的高准确度、高选择性的检测。TFP探针主要由三部分组成:线粒体靶向部分、H2O2响应部分和ATP响应部分。这项工作不仅为多物质同时成像提供了一种通用的分子设计方法,而且还揭示了氧化应激状态下线粒体内H2O2和ATP相关变化。相关研究成果发表在Journal of the American Chemical Society上,同时也被JACS的Spotlights专题介绍。
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【分析】基于单分子荧光探针用于神经元线粒体内H2O2和ATP的同时定量检测与实时荧光寿命成像
5,最新的美国研究:2型糖尿病会导致中风后认知能力的下降
来源:转化医学网
美国心脏协会下属的美国中风协会(American Stroke Association)的杂志《中风》(Stroke)在5月14日发表的一项最新研究表明,患有2型糖尿病的人,而不是那些患有糖尿病前期的人,在中风后3-6个月的认知能力比空腹血糖正常的人差。
该研究的资深作者医学博士裴明德·萨奇德夫表示,“2型糖尿病增加了中风的风险并与认知障碍有关,可能增加了痴呆症的风险,这就是为什么2型糖尿病是预防痴呆症的另一个重要目标,而重心应该放在对糖尿病前期的早期治疗上,延迟或避免发展为2型糖尿病。”
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【实锤】最新的美国研究:2型糖尿病会导致中风后认知能力的下降7,中国台湾2个研究队列的素食饮食与总、缺血性、出血性卒中发生率的关系
来源:浙江省脑卒中医疗质量控制中心
既往研究表明素食能降低血压、血糖、血脂,从而降低卒中风险。但同时,素食者摄入维生素B12低,这可能会增加同型半胱氨酸,导致卒中的风险增加。二者联合对卒中发病率的影响尚不明确。
来自中国台湾的Tina H.T. Chiu等人前瞻性调查了台湾素食者和非素食者卒中、缺血性和出血性卒中的发生率,并探讨了维生素B12摄入对素食与卒中风险关系的影响,结果表明素食与较低的缺血性和出血性卒中风险有关。文章发表在《Neurology》上。
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文献速递 |中国台湾2个研究队列的素食饮食与总、缺血性、出血性卒中发生率的关系
审校:Simon
来源:brainnews brainnews
原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2ODEyOTE3OQ==&mid=2649572796&idx=6&sn=2f52e2aace5104eb60f35d353a80d984&chksm=f2eda348c59a2a5e94b494127c1a5d83c93d405a758eb1387f0b2e4ce115167256e981f04704#rd
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