复旦大学附属中山医院肉瘤团队斩获2019年ESMO亚洲大会最佳展板学术资讯

来源：iNews

2019年11月22-24日，第五届欧洲肿瘤内科学会年会（ESMO）亚洲大会在新加坡召开。来自复旦大学附属中山医院的陆维祺教授、周宇红教授等多位在肉瘤领域极有建树的专家，共同撰写制作的肉瘤相关poster获得了最佳展板。

最佳展板

展板题目为“Integrated Genomic and Transcriptomic Analysis Revealed MutagenicPatterns of De-differentiated Liposarcoma and Leiomyosarcoma in ChinesePatients”。

L型肉瘤是软组织肉瘤中最常见的亚型，包括脂肪肉瘤(LPS)和平滑肌肉瘤(LMS)。LMS和去分化脂肪肉瘤 (DDLPS)的侵袭性强且复发率高，临床上的治疗手段以手术为主，但两者在组织学、生物学和临床行为上存在显著差异。

因此，来自复旦大学附属中山医院的专家团队携手领星对LMS和DDLPS样本进行了全外显子组测序(WES)和转录组分析（RNA-seq），以期能够找出LMS和DDLPS病因的关键区别，助力临床中的病理分型及治疗选择。

该研究共纳入了32例来源于中山医院的肉瘤患者，包括20例LMS及12例DDLPS，所有患者均进行了WES检测，其中8例LMS及8例DDLPS样本进行了RNA-seq检测。

对这些患者的基因检测数据进行分析后发现：

WES能够发现LMS和DDLPS中不同的遗传变异模式

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LMS与DDLPS之间差异程度最高的前20个基因如图A所示，其中55%的LMS携带了TP53的缺失或突变，而所有的DDLPS患者的TP53均为野生型，但拷贝数分析显示TP53的凋亡抑制因子MDM2在DDLPS中高度扩增（位于12q 14-15），提示了这两种肉瘤TP53通路失活的机制不同。

拷贝数变异的GISTIC分析显示（图B），LMS患者的拷贝数变化以TP53、RB1和PTEN等抑癌基因的缺失为主；而编码癌基因MDM2、CDK4和HMGA2的染色体12q14-15区的局灶性扩增是DDLPS最显著的特征。

RNA-seq揭示LMS和DDLPS中染色体结构变异差异

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在进行RNA-seq的8例LMS和8例DDLPS中，其中3例LMS（左图）中发现了4个融合转录本，在8例DDLPS（右图）中发现了36个融合转录本。

DDLPS样本的染色体重排显示了明显的染色体偏好性，12号染色体更容易形成融合转录本，其中包括10个染色体间重排转录本和12个染色体内重排转录本；100%的DDLPS患者MDM2/CDK4区域扩增，且这部分患者的MDM2/CDK4的表达水平进一步上调。

LMS和DDLPS差异表达基因的通路富集分析

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使用NetwokAnalyst在线分析LMS和DDLPS的基因表达差异后将差异最大的前50个基因进行了聚类分析并利用热图将结果可视化。

进行KEGG通路分析后富集到的前10条通路如下表所示：

总结

通过以上分析可以看出，LMS和DDPLS具有独特的突变模式，包括单核苷酸变异（SNV）和总体基因组不稳定。DDLPS样本中的染色体重排，特别是在12号染色体上的结构变异，会导致基因扩增和融合。这两种肉瘤中不同的基因表达模式也可能是导致两者临床表型不同的原因。此外，基因融合产生的新抗原可能为软组织肉瘤的免疫治疗开辟新的途径。

审核、编辑：大可

来源：MedicineWorld iNews

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