古代“口香糖”揭示人类基因组和口腔微生物组(有复原图)|《自然-通讯》

科技工作者之家 2019-12-18

来源:Nature自然科研

《自然-通讯》本周发表的一项研究A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch从一个被咀嚼过的桦树沥青样本中得到了一名5700年前丹麦人的全部基因组。对桦树沥青中含有的植物、动物和微生物DNA进行分析还揭示了这位个体的口腔微生物组和可能的饮食来源。

Lola的艺术复原图 | 来源:Tom Björklund

桦树沥清由桦树皮加热后产生,自中更新世(约76万-12.6万年前)开始一直被用作胶粘剂。考古遗址中曾发现过小块的桦树沥清,上面通常含有牙印,显示出这些物质曾被咀嚼过。

来自丹麦萨尔特岛的白桦沥青。| 来源:Theis Jensen

丹麦哥本哈根大学的Hannes Schroeder和同事对桦树沥清样本中的人类DNA进行测序,确定这名个体为女性;根据多个基因的遗传变异发现,她可能有着深色的头发、黝黑的肌肤、蓝色的眼睛。作者认为,相较于斯堪的那维亚中部的狩猎采集者,她与欧洲大陆的西方狩猎采集者的亲缘关系更为接近。研究人员还对桦树沥清中发现的非人类古代DNA进行了分析,检测到了具有口腔微生物特征的细菌物种,包括一些已知的病原菌,如与牙周病有关的牙龈卟啉单胞菌Porphyromonas gingivalis。此外,测得的DNA序列还能对应一些植物和动物,如榛子和野鸭,作者认为这可能是之前一餐的残留。

© nature

Ncomms | doi:10.1038/s41467-019-13549-9

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A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch


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