科技工作者之家
科技工作者之家APP是专注科技人才,知识分享与人才交流的服务平台。
科技工作者之家 2021-07-26
2021年7月17日,美国Oak Ridge National Laboratory,陈金贵团队在国际知名期刊Plant Biotechnology Journal在线发表题为“Towards engineering ectomycorrhization into switchgrass bioenergy crops via a lectin receptor-like kinase”的研究论文。该研究表明lectin receptor-like kinase基因PtLecRLK1通过改变植物的防御反应,影响外生菌根的定植;阐明了通过促进外生菌根的定植来增强植物在边际土壤中的生产力和适应性的理论基础。
作者利用先前在杨树中鉴定到的PtLecRLK1基因在柳枝稷中进行转化实验,结果表明PtLecRLK1基因的转入使得双色乳杆菌(L. bicolor)能够在柳枝稷根尖定植(图1)。由于柳枝稷并非是双色乳杆菌的寄主,但是在外源转入PtLecRLK1基因后却能使得两者建立共生关系;作者于是利用了转录组、蛋白质和代谢组的数据用于探究其中的分子机制。
图1:野生型(A)与PtLecRLK1转基因材料(B)中根尖荧光染色切片
在野生型和转基因材料接种双色乳杆菌两个月后,提取了整个根尖的RNA,进行转录组分析。通过PCA分析作者发现在接种真菌后,转基因基因材料与野生型材料之间转录组存在巨大差异(图2A)。在野生型没有接种真菌与接种真菌进行比较发现,差异基因主要参与到氧化还原反应,碳水化合物代谢等生物学过程(图2C)。转基因材料与野生型材料在接种后进行比较发现,差异基因主要参与到响应外界刺激、植物微生物识别以及营养上调等生物学过程。作者猜想这些生物学途径的改变可能有利于真菌和宿主间共生关系的建立。
图2:野生型与转基因材料的转录组分析
为了进一步的揭示共生关系建立过程中,基因表达网络中关键节点的变化;作者利用两个材料在接种前后的转录组数据构建了共表达网络,15,606个差异表达的基因构成了16个主要的模块(图3A)。PtLecRLK1基因及与其共表达的基因,主要在接种后的转基因材料中表达(图3C)。一个调节细胞骨架及信号蛋白的基因Pavir.5KG693600直接与PtLecRLK1基因的表达相关。通过共表达网络分析作者推测PtLecRLK1可能作为初始的信号受体或相关的蛋白激酶,随后触发下游的级联反应最终导致促进共生关系的形成。
图3:野生型和PtLecRLK1突变体构建的基因共表达网络
为了进一步的验证猜想,作者同时利用了相同的材料,从蛋白质翻译水平和代谢水平分析了PtLecRLK1基因调控的分子机制。对差异表达的蛋白质进行富集分析,富集的结果与转录组中功能富集结果类似,生物逆境相关的途径中与茉莉酸和乙烯信号相关的蛋白质丰度减少,这些蛋白质含量的变化有利于改变植物的防御反应。
来源:植物科学最前沿
原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247519871&idx=4&sn=f275f29209ad6b4c16514a692b5041db
版权声明:除非特别注明,本站所载内容来源于互联网、微信公众号等公开渠道,不代表本站观点,仅供参考、交流、公益传播之目的。转载的稿件版权归原作者或机构所有,如有侵权,请联系删除。
电话:(010)86409582
邮箱:kejie@scimall.org.cn
“NASA材料基因工程2040规划”研究与思考
航发科普 | 材料基因组计划与材料计算工具
清华团队探微揭秘!飞秒激光改写材料“基因”
材料基因工程在船舶领域的应用思路
NASA证实太空旅行对人体影响大:改变基因表达方式
全新量子材料“外尔—近藤半金属”问世
npj: 材料基因组计划的最新前沿
科学研究新发现,gay真的是天生的!
材料科普:材料信息学 - 解码材料基因图谱丨科普硅立方
感觉到了压力?你说的话比你自己更敏感