陷入罗生门的中间宿主研究：陈金平团队指出穿山甲可能不是新冠病毒中间宿主学术资讯

来源：生物学霸

2 月 6 日，华南农业大学宣布发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主。
2 月 20 日，管轶教授团队在生物预印本 bioRxiv 在线发表论文，从反走私行动中查获的多个穿山甲样本进行检测，并在穿山甲样本中发现了新冠病毒相关冠状病毒，属于此次新冠病毒的两个亚型，其中一个受体结合域与新冠病毒密切相关。随后，华南农业大学的论文也在 bioRxiv 上线。
然而，这两项研究并不能打消所有疑虑，也没有直接确定性证据表明穿山甲就是此次新冠病毒的中间宿主。

近日，广东省生物资源应用研究所陈金平教授团队在生物预印本 bioRxiv 在线发表了一篇题为：Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) ? 的研究论文。
论文指出，虽然穿山甲所携带的冠状病毒的确与新冠病毒（SARS-CoV-2）有遗传相关性，但却可能不是本次疫情的中间宿主。

确定病毒中间宿主十分迫切
2019 年 12 月，湖北武汉市爆发了一次原因不明的肺炎疫情（COVID-19），随后，研究人员确定导致该疫情的病原体新型冠状病毒（SARS-CoV-2）。
为了有效防控疫情，科学家们迫切需要确定新冠病毒的真实中间宿主。由于华南海鲜市场上出售了大量各种野生动物，所以，尚且未知哪种动物是病毒的中间宿主。
冠状病毒可引起呼吸道和胃肠道感染，除了 SARS-CoV-2 之外，冠状病毒家族还包括引起 2003 年 SARS 疫情的 SARS-CoV 病毒和 2012 年引起中东呼吸综合症疫情的 MERS-CoV 病毒。
冠状病毒含有大约 3 万个碱基组成的基因组，这些基因组编码了多达 11 种蛋白质，通过计算模型分析后发现，SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 病毒均把血管紧张素转换酶 2（ACE2）作为与人体细胞结合的主要受体。

获得穿山甲冠状病毒的基因组序列
2019 年 3 月，研究人员从广东海关截获了 26 只走私的马来穿山甲中的 3 只样本中检测出了冠状病毒的存在。
随后，研究人员对这三只死亡的穿山甲收集了基因组测序样本，并组合成了穿山甲冠状病毒的基因组序列，即：pangolin-CoV-2020，该序列约有 29380 个核苷酸，约占病毒基因组的 84％，如下图所示。

值得注意的是，下表的基因组分析结果表明，穿山甲携带的 pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2 和蝙蝠身上的 Bat-CoV-RaTG13 都具有高度同源性。
此外，就病毒 S 蛋白的核苷酸序列同源性而言，pangolin-CoV-2020 和 SARS-CoV-2 之间高达 82.21％。

以上结果都表明，pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2 以及 SARS-CoV 可以共享相同的受体 ACE2。
如下图所示，根据系统发育分析结果表明，与冠状病毒的其他成员相比，pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2 和蝙蝠冠状病毒（Bat-CoV-RaTG13）的 S 基因在遗传上更加相似。

另外，系统发育树表明，蝙蝠身上的冠状病毒（Bat-CoV-RaTG13）在基因组序列上都更接近 SARS-CoV-2。

不能武断穿山甲是中间宿主
有趣的是，研究人员发现，SARS-CoV-2 的 S1 蛋白和 S2 蛋白之间有多个插入的 PRRA 短序列，这再次证实了科学家的猜测：在蝙蝠和人类之间很可能存在着另一个病毒中间宿主，也就是说，此次新冠病毒并非由蝙蝠直接传播给人类，而是经过了一个中间宿主进行的传播。
冠状病毒的 S 蛋白通过受体结合域与宿主受体结合，之前的研究表明，SARS-CoV-2、SARS-CoV 和 Bat-CoV-RaTG13 具有相似的受体结合域，但是本文的分析结果表明，存在于穿山甲中的 ACE2 受体具有高度序列保守性，因此，尚不清楚 pangolin-CoV-2020 的人畜共患病情况。
最后，作者指出，本文的研究结果支持蝙蝠是 SARS-CoV-2 的起源，但是动物源性冠状病毒的宿主范围是混杂的，在不清楚 pangolin-CoV-2020 的人畜共患病情况时，并不能武断穿山甲就是 SARS-CoV-2 的中间宿主！

文章来源：BioWorld封面来源：站酷海洛 Plus
论文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.18.954628v1.full

来源：ShengWuXueBa 生物学霸

原文链接：http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA4OTQ1MTQxNg==&mid=2652070313&idx=6&sn=b9685c15eeae8354c7a0c821b7dcb6a2&chksm=8bfd7f5ebc8af6482fe0638cbdeb59cafd7c145921fea7d95f04449b44cdd0266e945a022858&scene=27#wechat_redirect

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