Genome Biology | 拟南芥转录机制研究重要进展

科技工作者之家 2019-05-27

来源:植物科学最前沿


染色质的动态变化依赖于核小体定位、DNA甲基化和组蛋白翻译后修饰等。拟南芥已建立了组蛋白翻译后修饰的全基因组图谱,H3、H4、H2Bub、H3K4me2/3, H3K36me2/3为转录活性基因。组蛋白修饰的组合有助于创建染色质状态和调控转录活性。在酵母中H3K4me3的富集是由SET1组蛋白甲基转移酶催化,泛素化H2B是富集H3K4me3的前提条件。在真核生物中COMPASS-like H3K4me3组蛋白甲基转移酶具有进化保守性。H3K4me3通常存在于转录起始位点周围的少数核小体上,在许多真核生物中,H3K4me3在功能上与RNPII转录激活和延伸有关。在植物中尚未建立起H3K4me3和H2Bub之间的分子机制

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近日,Genome Biology杂志在线发表了巴黎文理研究大学Fredy Barneche团队题为“Arabidopsis S2Lb links AtCOMPASS-like and SDG2 activity in H3K4me3 independently from histone H2B monoubiquitination”的研究论文,揭示了在拟南芥中,S2Lb与进化保守的COMPASS-like复合物和植物特异性SDG2组蛋白甲基转移酶相关联共同调控大量基因,H3K4me3的富集独立于H2B的泛素化途径。

本研究中发现S2Lb和SDG2都直接影响H3K4me3在高转录活性基因上的富集。敲除S2Lb在营养和生殖阶段可产生多效性发育表型,包括降低生育力和种子休眠。与S2Lb,SDG2,或H3K4me3靶向大量基因相比s2lb幼苗表现出较少的转录缺陷,这表明H3K4me3的富集不是决定转录状态的开关。此外,与酵母不同,拟南芥中大多数S2Lb和H3K4me3基因组分布不依赖于组蛋白H2B泛素化。

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原文链接:

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1705-4


来源:frontiersin 植物科学最前沿

原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247491996&idx=3&sn=f9d32699bcd966ffafbb2c605636e8e0&chksm=e8bd9382dfca1a944438848a79bb502deff1b14d8a9959864984c35c02c937e182fe5401c427&scene=27#wechat_redirect

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