首次解析儿童神经母细胞瘤单细胞图谱

科技工作者之家 2020-09-21

9月17日,复旦大学附属儿科医院肿瘤外科李凯、董瑞团队和上海交通大学王嘉团队联合在《癌细胞》发表研究,他们利用单细胞测序技术首次解析了儿童神经母细胞瘤的单细胞图谱。

神经母细胞瘤是儿童最常见的颅外实体肿瘤,又称为儿童癌症之王。神经母细胞瘤在临床上具有广泛的异质性,其中某些类型表现出高度转移以及易复发等恶性肿瘤特征,而另外一些类型则可以在不经治疗的情况下发生消退以致肿瘤完全消失。

为了阐明神经母细胞瘤肿瘤细胞清晰的表型,研究人员利用10x Genomics平台分别对胎儿肾上腺样本以及神经母细胞瘤肿瘤样本进行单细胞转录组测序。基于这一数据,研究人员发现神经母细胞瘤在表型上非常接近肾上腺的嗜铬细胞。

研究人员为了确认该发现的可靠性,使用了多种分析方法,包括细胞间相似性分析、转录因子调控网络分析、公共数据库分析等。

在此基础上,研究人员进一步推测嗜铬细胞的两种不同的状态(增殖型和分化型)可能与肿瘤异质性高度相关。单细胞数据的分析验证了该猜测,显示出肿瘤细胞增殖和分化状态与正常发育的嗜铬细胞状态高度相似。研究人员随后分析了嗜铬细胞两种不同状态的特征基因在Bulk数据库的表达模式,发现增殖型和分化型特征分别对应着较差和较好的预后,提示这些新发现的特征基因可以作为神经母细胞瘤临床诊断的潜在分子标志物。

该项研究首次利用单细胞转录组测序技术阐明了神经母细胞瘤肿瘤细胞的分子表型,揭示了嗜铬细胞的两种不同分化状态和神经母细胞的异质性高度相关,为研究神经母细胞瘤细胞起源及关键调控基因贡献了单细胞数据资源。

相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.08.014

来源:中国科学报

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原文链接:http://news.sciencenet.cn//sbhtmlnews/2020/9/357844.shtm

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