内蒙古大学齐建建教授团队创造出自交亲和、100%纯合的二倍体马铃薯新种质

科技工作者之家 2020-09-24

来源:植物科学最前沿

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马铃薯是我国重要的菜粮兼用作物。广泛栽培的马铃薯品种是基因组高度杂合的四倍体,遗传分离极其复杂,且存在严重的自交衰退。缺乏合适的模式研究材料,是目前马铃薯功能基因遗传定位与分离克隆工作面临的主要难题。

近日,JIPB在线发表了内蒙古大学齐建建教授团队题为“Developing a new model system for potato genetics by androgenesis”的研究论文。该研究以野生二倍体马铃薯Solanum verrucosum为供体,通过小孢子培养创制了自交亲和、100%纯合的二倍体马铃薯新种质SVA4SVA32,丰富了马铃薯遗传研究的材料类型,也为下一步马铃薯突变体库创制工作奠定了基础。

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自交亲和、纯合二倍体马铃薯SVA4和SVA32的创制与鉴定

A)11种小孢子诱导培养基激素组分与植株再生统计;(B)由胚状体和愈伤组织诱导获得再生植株;(C)流式细胞法(左)和根尖染色体计数(右)鉴定再生植株倍性;(D)SVA4与SVA32表型;(E)全基因组重测序鉴定SVA4与SVA32纯合度;(F)供体PI275256中杂合SNP窗口的频数分布。

齐建建教授团队以自交亲和的杂合二倍体马铃薯S. verrucosum(PI275256)为供体,通过筛选11种不同成分的诱导培养基,获得23份再生材料。结合根尖染色体计数、流式细胞法等对再生植株进行倍性鉴定,发现其中6份为二倍体、17份为一倍体。利用22对多态性InDel标记进行纯合度分析,发现这6份二倍体的理论纯合度接近100%。团队对上述二倍体材料进行了为期两年的表型评价(包括株型、自交亲和性、结实率、结薯情况等),最终成功筛选出两份表现优良的二倍体SVA4SVA32,二者具备了经典模式植物纯合、可自交、易于遗传转化等特点。本文通过全基因组重测序获得了更为精准的SNP基因型数据,分析结果进一步证明SVA4和SVA32是完全纯合的二倍体材料。

此外,该研究还开发了基于重测序数据的再生植物材料纯合度鉴定方法。与传统的SSRInDel等分子标记体系相比,该方法可将遗传位点检测数量提高1000倍以上。这种方法也可用于其他物种后代群体的纯合度评估。

来源:frontiersin 植物科学最前沿

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马铃薯 二倍体 基因遗传

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